Avril 2002 - n°67
PROTEOMIC SOLUTIONS : Prestataire de services en protéomique
Le laboratoire PROTEOMIC SOLUTIONS , dirigé par M. Dutriat, a été créé en mars 2001 pour répondre aux besoins du marché protéomique, mais aussi pour travailler sur des axes de recherche utilisant les techniques de l’analyse protéomique. Implanté entre Paris et Rouen, le laboratoire dispose de 100 m2 de locaux et regroupe une équipe de scientifiques placés sous la responsabilité du Dr. SARAZIN, qui travaille en étroite collaboration avec le Dr. PERNOLLET (directeur de recherches à l’INRA) : un contrat de valorisation entre Proteomic Solutions, ATI (Agronomie-Transfert Innovation) et l’INRA a en effet été signé, ce qui permet à la société de bénéficier du concours scientifique de l’INRA.
Le laboratoire de recherche et d’analyses protéomiques
et post-génomiques oriente ses activités autour de 4 grands axes
:
- l’identification de tout ou partie des protéines exprimées
dans un tissu donné d’un organisme vivant (animal, végétal
ou microbien) dans un environnement déterminé (génétique,
physiologique, pathologique)
- le contrôle des matières premières
- la traçabilité des OGM
- l’identification des marqueurs peptidiques ou protéiques pour
une utilisation en clinique ou en diagnostic humain ou animal
Parmi les services proposés pour l’analyse protéomique :
- réalisation de l’électrophorèse
bidimensionnelle : 1ère dimension sur bande, 2ème dimension sur
gel d’acrylamide homogène ou à gradient Coloration au bleu
de coomassie colloïdal ou au nitrate d’argent ammoniacal. Acquisition
des données, matching, création d’une image synthétique,
édition d’un rapport (dénombrement, coordonnées des
spots, point isoélectrique, poids moléculaire)
- analyse d’image : appariement de l’image, analyse approfondie
des spots et quantification relative, analyse protéomique différentielle,
rapprochement entre différents gels de protéines, recherche dans
les bases protéiques.
- transfert des protéines sur membrane ProblottTM
- identification de spots par spectrométrie de masse MALDI-TOF après
trypsinolyse et recherche dans les banques de données protéiques.
- analyse complémentaire d’éléments de séquence
par PSD/CID
- analyse de séquence N-terminale (dégradation chimique d’Edman)
en vue de l’identification en banque ou pour la synthèse de sondes
d’oligonucléotides destinées au clonage
- carte peptidique obtenue par chromatographie liquide haute performance en
phase inverse couplée à la spectrométrie de masse electrospray
après clivage par divers agents enzymatiques ou chimiques. Repérage
de modifications post-traductionnelles par comparaison des masses peptidiques.
L’objectif du laboratoire est d’assurer de manière fiable et rapide des prestations de service en protéomique, à destination des laboratoires industriels et académiques, en garantissant bien sûr la plus stricte confidentialité à ses clients.
Contact :
M. Dutriat
M. Sarazin