Juin 2002 - n°69
AgroGène
Leader de l’innovation technologique appliquée à la recherche
et à la production végétales
Depuis notre premier reportage il y a 6 ans (cf Les Archives
de La Gazette sur http://gazettelabo.fr), l’entreprise a largement consolidé
sa position dans le domaine de l’innovation technologique appliquée
aux plantes et aux produits d’origine végétale.
Toujours au premier plan de son expertise, le marquage moléculaire et
ses multiples techniques : AFLPTM , amplification génique par PCR®,
microsatellites en fluorescence, SNP...
De nouvelles prestations de services sont venues compléter l'offre d'Agrogène
à l’échelle internationale, en réponse à la
demande croissante et aux besoins de plus en plus pointus du monde semencier.
Constituée de 8 personnes en 1996, l’équipe AgroGène
compte aujourd'hui 30 collaborateurs . De nombreux recrutements ont en effet
été réalisés au sein des unités techniques,
en parallèle de la création d’une cellule Qualité
et de Départements dédiés à la R&D ainsi qu’à
la Détection des OGM..
M. Vincent WICKAERT, qui a rejoint AgroGène en 1997 en tant que responsable
Marketing – Communication, fait le point sur l’actualité
d’AgroGène.
Services, expertise, précision et confidentialité
" AgroGène fournit en toute confidentialité
des produits et des services apportant des avantages concurrentiels aux différents
acteurs de la filière agricole et agro-industrielle : sélectionneurs,
producteurs et acheteurs de produits végétaux, transformateurs
agro-industriels " : c’est ainsi que M. LACAZE, Directeur du
Développement d’AgroGène, définissait fin 1996 le
fil conducteur des activités de sa société.
" Notre vocation est restée intacte et AgroGène s’impose
aujourd’hui plus que jamais à la pointe des technologies de génétique,
de biologie moléculaire et cellulaire végétales ",
complète M. WICKAERT.
Prestations de service, développement, conseil et formation, contrôle
qualité, recherche sous contrat… : les activités du laboratoire
rayonnent à l’échelle internationale, intéressant
majoritairement l’industrie semencière, mais aussi l’ensemble
des fournisseurs et utilisateurs de matières premières végétales.
La confidentialité des travaux, le suivi étroit de la clientèle
et l’adaptabilité des prestations aux conditions les plus diverses
(durée de l’étude, espèces végétales
considérées, techniques utilisées…) font d’AgroGène
un partenaire privilégié de l’Industrie.
La société, dont les laboratoires sont basés à Moissy-Cramayel,
à 35 km au sud-est de Paris, a été créée
en 1991 à l’initiative de semenciers, d’agroindustriels et
de coopératives. Il y a 4 ans, PE Biosystems, (aujourd’hui APPLERA)
entre à hauteur de 49% dans son capital : AgroGène bénéficie
dès lors de moyens adaptés à des investissements matériels
plus lourds et profite en temps réel des avancées technologiques
développées par le groupe APPLERA en matière de biologie
moléculaire.
Parmi les acquisitions récentes : deux appareils d’électrophorèse
capillaire – l’un monocapillaire et l’autre 16 capillaires,
ainsi que deux appareils de PCR® quantitative en temps réel (Chimie
TaqMan®) dont l’un doté d’une plate-forme haut débit
384 puits et un automate de préparation 384.
Le marquage moléculaire : métier de base d’AgroGène
" L’analyse moléculaire constitue le
métier premier d’AgroGène ", nous confie M. WICKAERT.
" En 1996, nous cherchions avant tout à faire connaître
ce nouvel outil et à démontrer ses nombreux atouts. Aujourd’hui,
tout est bien différent : le concept a été parfaitement
intégré par l’industrie ; les applications se multiplient
et les nouvelles demandes, de plus en plus nombreuses, émanent des utilisateurs
eux-mêmes… "
Au cœur du savoir-faire d’AgroGène : le marquage moléculaire
appliqué aux espèces végétales, c’est-à-dire
la localisation des gènes d’intérêt ou, plus exactement,
des marqueurs liés aux loci de ces gènes, dans le génome
végétal. Une fois localisés, ces marqueurs peuvent être
identifiés et contribuer ainsi à une meilleure caractérisation
génétique. Les possibilités offertes en termes d’applications
sont particulièrement nombreuses : du contrôle qualité à
l’identification variétale et à la protection de la propriété
intellectuelle, jusqu’à l’optimisation des espèces
et des produits agroalimentaires en adéquation avec les besoins des marchés
visés.
La gestion des ressources génétiques et la traçabilité
génétique, la sélection végétale assistée
par marqueurs, l’analyse de divergence génétique (EDV :
variétés essentiellement dérivées), le développement
de marqueurs haut débit, ou encore, le contrôle de la pureté
des semences s’imposent aujourd’hui parmi les prestations phares
d’AgroGène.
Trois technologies de pointe sont principalement utilisées : les AFLPTM
(amplified fragment length polymorphism) capables d’identifier avec précision
le polymorphisme des espèces et applicables à tout ADN, donc toute
espèce végétale, les SSR (microsatellites), technique très
robuste et parfaitement reproductible pour la mise en évidence de séquences
répétées dans le génome et les SNP qui permettent
au sein du gène de sélectionner le meilleur allèle.
Ces techniques, bien qu’inchangées dans leur concept de base, ont été nettement optimisées dans leur mise en œuvre…
" Par exemple, les microsatellites sont passés
de méthodes sur gel de séquençage manuel à des protocoles
intégrant des avancées technologiques essentielles : amorces avec
, marquage flurorescent, amplification en multiplex et révélation
par électrophorèse capillaire sur séquenceur automatique,...",
explique Vincent WICKAERT.
Les importantes acquisitions matérielles et la large automatisation du
parc instrumental d’AgroGène visent donc à remplir un triple
objectif : répondre à la problématique Temps imposée
par la croissance de la plante, réduire le coût de l’analyse
et, bien sûr, étendre le nombre d’échantillons et
de marqueurs étudiés : le haut-débit.
De fait, AgroGène est aujourd’hui en mesure d’appliquer son
savoir-faire à toutes espèces végétales : potagères,
ornementales et grandes cultures...
Depuis deux ans, l'équipe a développé des milliers de marqueurs
dont plusieurs sets optimisés de microsatellites cartographiés
ou spécifiquement conçus pour le contrôle de pureté
des semences.
" En 5 jours seulement et avant commercialisation, vous validez la
conformité de vos lots de semences avec la référence de
la variété considérée ", souligne M. WICKAERT.
Notons que la notion d’EDV (Variétés Essentiellement Dérivées),
pourrait aujourd’hui être complétée par le marquage
moléculaire ; " les nouvelles variétés apparaissent
de plus en plus proches et semblables sur le plan phénotypique. Le contrôle
d’enregistrement par simple méthode visuelle atteint par moment
ses limites. Seuls les outils moléculaires pourraient apporter une précision
supplémentaire pour calculer le pourcentage de dérivation…
", poursuit Vincent WICKAERT.
AgroGène maîtrise ces outils au plus haut niveau et leurs applications
sont promises à des développements toujours plus nombreux. Fort
de plus de 12 ans d’expertise en génétique et recherche
appliquée aux plantes, l’équipe AgroGène est aujourd’hui
sollicitée par les plus grands groupes internationaux pour ses compétences
en marquage moléculaire.
Un leadership également incontestable en matière de détection des OGM
Spécialiste reconnu du développement et de l’optimisation
de marqueurs haut débit, AgroGène l’est également
aujourd’hui en matière de détection des OGM, sur le marché
agricole et agro-industriel.
Il y a trois ans, alors que sont définies les premières exigences
normatives sur les organismes génétiquement modifiés, le
laboratoire décide de mettre à profit sa connaissance du monde
semencier ainsi que son expertise en génétique des plantes cultivées,
en étendant son offre à la détection de ces plantes transgéniques.
L’une des collaboratrices d’AgroGène, Chrystèle DELOBEL,
participe dès lors activement aux travaux de l’AFNOR et organise
dans le cadre de la Commission OGM un circuit test inter laboratoires. En parallèle,
les recherches menées au sein de l’entreprise conduisent à
la mise au point de plusieurs tests particulièrement intéressants
dont un basé sur le promoteur " p35S " - aujourd’hui
validé comme le meilleur et utilisé au sein du groupe AFNOR et
dans des futurs programmes européens.
Etroitement impliquée dans l’élaboration des normes et auteur
d’avancées méthodologiques fondamentales pour la détection
des OGM, l’équipe d’AgroGène est en mesure de traiter
plusieurs centaines d’échantillons par jour. Une remarquable capacité
d’analyse dont elle peut se prévaloir depuis l’acquisition
d’un second appareil de PCR quantitative en temps réel l’ABI
7900HT.
Autre élément essentiel : cet équipement sert également
de plate-forme SNP qui, contrairement aux techniques microsatellites opérant
au niveau du gène, offre l’opportunité de travailler à
l’échelle de l’allèle !
" Notre activité OGM a pris une ampleur considérable
depuis sa création, il y a trois ans ", se félicite
M. WICKAERT. " Elle couvre en effet aujourd’hui plus de 60% des
analyses effectuées sur le maïs et près de 90% du colza européen.
"
Clé de cette réussite et gage de la qualité des services
proposés par le Laboratoire : une gamme étendue et validée
de tests, la conformité de ses prestations avec les BPL et norme AFNOR,
son système d’assurance-qualité ISO 17025, sa politique
rigoureuse en matière de propriété intellectuelle et de
licences (PCR®, TaqMan®), mais aussi et surtout le succès des
tests inter laboratoires et des audits réalisés par ses clients
qui n’ont fait que renforcer leur confiance.
Précisons pour conclure qu’AgroGène est la seule société
au monde, détentrice d’une licence AFLPTM dans le cadre des prestations
qu’elle développe sur les plantes et les champignons. En matière
de détection OGM, toute son équipe est également prête
aujourd’hui à engager une démarche d’accréditation
COFRAC - reste au COFRAC à finaliser le programme correspondant !..
A suivre…
SD
Prochain séminaire AgroGene
:
" High Throughput Genotyping : Technology, Applications & Perspectives
",
les 27 et 28 Février 2003 à Paris
Contact :
Vincent WICKAERT