Décembre 2002 - n°73
ProtNeteomix et le laboratoire de Biotechnologie :
de nouvelles technologies pour la post-génomique et la protéomique
La société ProtNeteomix a vu le jour officiellement le 1er octobre
2002. Elle est issue de recherches scientifiques effectuées dans le
laboratoire de Biotechnologie (unité CNRS FRE 2230) de la faculté
des Sciences et Techniques de l’université de Nantes. Dirigée
par le Professeur Vehary SAKANYAN, cette équipe incluant les Maîtres
de Conférences, Michèle LECOCQ, Pierre WEIGEL, Laetitia GUEVEL,
Frédérique BRAUN et une technicienne du CNRS, Marie-Claire ARNAUD,
a accumulé d’importantes connaissances en biologie moléculaire
et en microbiologie et a été amenée, dans le cadre de
ses travaux, à développer des technologies innovantes destinées
à l’étude à haut débit des protéines.
Deux thésards, Marina SNAPYAN et Amélie MORIN et un chercheur
PostDoc, Anahit GHOCHIKYAN, ont aussi contribué de façon importante
à ces travaux.
« Nous proposons un nouveau concept de préparation de puces
à partir de protéines synthétisées in vitro qui
permettra d’étudier les interactions moléculaires à
haut débit de façon rapide et sensible. En tenant compte des
avantages de nos technologies, leur intégration ouvre de nouvelles
perspectives dans différents domaines des sciences du vivant. Nous
pouvons effectuer le criblage de protéines-cibles, évaluer leur
affinité relative pour des sondes désirées et identifier
des inhibiteurs potentiels d’intérêt appliqué ou
fondamental à la demande d’organismes industriels ou universitaires»,
expliquent les auteurs, qui ont décidé de réaliser leurs
idées par la création d’une société.
Vehary SAKANYAN est devenu successivement lauréat en 2001 et 2002 des
3ème et 4ème concours nationaux “création d ‘entreprises
innovantes”, sous l’égide du Ministère de la Recherche
dans les catégories " émergence " et " création
". Avec Frédéric MARC il est aussi lauréat du concours
Aventis 2002 “ création d’entreprise innovante en santé
humaine ”.
L’application des technologies développées au sein de
la start-up ProtNeteomix a été confiée à Frédéric
MARC qui a soutenu sa thèse sous la direction de Vehary SAKANYAN.
La direction de ProtNeteomix
Elle est assurée par 2 scientifiques :
> Frédéric MARC, PDG de la société,
est Docteur en biologie et peut se prévaloir d’une solide expérience
dans le domaine de la biologie moléculaire. Il a effectué un
stage post-doctoral au département de microbiologie de l’université
de l’état de l’Ohio à Colombus (USA), avant de se
lancer dans le démarrage de ProtNeteomix.
> Créateur de la société et président
du conseil scientifique, Vehary SAKANYAN enseigne la microbiologie et la biotechnologie
à l’université de Nantes. Avant son arrivée à
Nantes en 1992, il a successivement co-dirigé le laboratoire de génétique
moléculaire à Moscou de 1978 à 1981, puis créé
et dirigé, de 1982 à 1990, le laboratoire de génie génétique
à Erevan et, de 1989 à 1992, une entreprise de biotechnologie,
spécialisée dans la production microbiologique d’acides
aminés et d’enzymes. L’expérience acquise déjà
dans l’application industrielle de ses résultats scientifiques,
a permis à Vehary SAKANYAN de proposer un programme ambitieux de R&D
pour ProtNeteomix avec plusieurs partenaires en s’appuyant sur les avantages
des technologies développées.
L’activité de ProtNeteomix
Aujourd’hui, les séquences du génome de nombreux organismes,
y compris l’homme, sont disponibles et l’enjeu actuel est de mieux
connaître la fonction des protéines codées par ces génomes.
En effet, tous les processus physiologiques sont le résultat des reconnaissances
et des interactions entre les protéines et d’autres biomolécules
(protéines, peptides, anticorps, ADN, ARN, petites molécules,
etc…). De ce fait, il existe une forte demande dans tous les domaines
de la biologie pour une technologie permettant l’analyse fonctionnelle
des protéines à haut débit dans le but de :
1/ décoder l’information génétique masquée
par les génomes séquencés ;
2/ élucider les interactions de différentes protéines
avec d’autres molécules dans les systèmes biologiques
complexes ;
3/ rechercher des cibles et identifier des composés thérapeutiques
contre les maladies.
L’activité de ProtNeteomix s’articule autour de 2 grands
pôles : la production d’une part et le programme de R&D d’autre
part. Sa plate-forme s’appuie sur 3 technologies brevetées par
le laboratoire de Biotechnologie :
- Protein Expression : production in vitro et purification de protéines
en quantité analytique
- Protein Array : fabrication de puces à protéines
- Protein Interactome : examen des interactions entre molécules
" Notre concept permet d’accélérer de manière
significative les étapes de la découverte de cibles et de molécules
actives. De plus, nos technologies peuvent être utilisées indépendamment
l’une de l’autre et répondre à différentes
questions fondamentales et appliquées. Notre procédé
est complètement robotisable et les opérations sont plus sensibles
et moins coûteuses par rapport aux méthodes conventionnelles
", affirme Frédéric MARC.
Un environnement favorable et une stratégie
bien définie
ProtNeteomix effectuera ses activités en partenariat avec des équipes
de recherche universitaires : le laboratoire de Biotechnologie de Nantes,
l’unité INSERM U522 à Rennes (Pr. C. GUILLOUZO) et le
laboratoire de Génétique Moléculaire de l’université
de Mexico (Pr. K. GAZARIAN).
L’université de Nantes a accordé à ProtNeteomix
une licence exclusive mondiale pour les deux brevets européens du laboratoire
de Biotechnologie déposés en juillet 2001. Le premier protège
les innovations concernant la synthèse rapide et efficace des protéines
dans un système acellulaire, le second protège la méthode
de fabrication des puces et de détection très sensible des interactions
moléculaires en utilisant des sondes marquées par des fluorophores
particuliers.
ProtNeteomix, composée de 5 personnes, est, dans un premier temps,
localisée au sein du laboratoire de Biotechnologie de la faculté
des Sciences et Techniques de l’université de Nantes, ce qui
lui permet, d’une part, de rester en contact avec l’équipe
de recherche expérimentée, d’autre part, de bénéficier
des équipements et matériels dans le cadre d’une convention
avec l’université.
L’emménagement dans une pépinière d’entreprises
est envisagé au cours du second semestre 2003.
Les objectifs de ProtNeteomix sont clairement définis :
1/ générer des revenus à court et moyen terme grâce
à une activité de prestation de recherche ;
2/ développer, au sein de la société ou en partenariat,
des puces à protéines afin de créer de nouveaux outils
de diagnostic pour des pathologies humaines et pour la découverte de
cibles et molécules actives d’intérêt thérapeutique.
ProtNeteomix mène actuellement son premier tour de table pour assurer
les premières phases de son développement.
En outre, le Génopole Ouest a pris récemment la décision
de créer une plate-forme technologique " Puces à protéines
" au sein du laboratoire de Biotechnologie.
CD
Contacts :
Vehary SAKANYAN
Laboratoire de Biotechnologie/ProtNeteomix
Frédéric MARC
ProtNeteomix