Mai 2005 - n°99
BIOMETHODES, spécialisée dans l’évolution dirigée des protéines, investit de nouveaux locaux et étend ses activités
BIOMETHODES, société de biotechnologie spécialisée
dans l’évolution dirigée des protéines, a été
créée par le Dr Marc DELCOURT en 1997, à Evry (91). Hébergée
à ses débuts par l’équipe du Généthon,
elle a ensuite pris place dans les locaux de la pépinière Genopole®Entreprises.
Fin 2004, afin de poursuivre le développement de ses activités,
l’Entreprise déménage de nouveau, pour des installations
plus vastes au sein du bâtiment Genavenir 8 (Genopole® Campus 1).
De nouveaux laboratoires, investis parallèlement au recrutement de
sept collaborateurs et à l’acquisition de nouveaux équipements
technologiques.
Gros plan sur BIOMETHODES et son actualité !
Un objectif phare : améliorer la valeur
des protéines
BIOMETHODES développe et met en application ses technologies propriétaires
dans le domaine de l'évolution moléculaire, dans le but d'optimiser
des protéines (enzymes, anticorps ou protéines thérapeutiques)
pour des applications industrielles ou médicales.
L’Entreprise a ainsi en particulier été la première
à proposer une technologie de mutagenèse dirigée à
haut débit : Massive Mutagenesis®. Une méthode mise sur
le marché en 2001 ; la seule technologie de mutagenèse dirigée
combinatoire à haut débit !
“ La lenteur des procédés de mutagenèse dirigée
est un facteur limitant pour beaucoup de projets liés à la manipulation
d’ADN ; Massive Mutagenesis® a été conçue pour
passer outre ces limites… ” nous expliquait dans un précédent
reportage, en mai 2002, M. DELCOURT. “ Notre technologie est totalement
indépendante des autres brevets existants dans le domaine. Grâce
à la maîtrise du nombre de mutations par gène ainsi que
du type de mutation (substitution, délétion ou insertion), nous
sommes les premiers à contrôler précisément la
diversité que nous générons… ”
Le potentiel d’utilisation de Massive Mutagenesis® est remarquable
: des études fonctionnelles à l’évolution moléculaire
dirigée. C’est à la fois un outil qui permet l’amélioration
moléculaire de protéines et une plate-forme pour la conception
de nouveaux principes actifs grâce à la cartographie des sites
d’interaction Ligand-Récepteur. La technologie Massive Mutagenesis®
est ainsi capable de générer des mutants dirigés à
haut débit et de façon combinatoire, permettant la création
de banques de mutants à partir de n’importe quel gène.
Combinée avec une plate-forme de criblage à haut débit,
cette technologie a été validée par l'obtention de biocatalyseurs,
de protéines et d’anticorps améliorés pour diverses
propriétés.
Une vingtaine de partenariats signés
avec l’Industrie
L’équipe BIOMETHODES a ainsi conclu plus de vingt partenariats
avec des groupes industriels pharmaceutiques et agro-alimentaires, en France
et à l’étranger, parallèlement à ses collaborations
engagées avec de nombreuses sociétés de biotechnologie
et institutions de recherche publique. Parmi ces partenaires, on compte :
Cellectis, Roquette, Aventis, Biomérieux, GSK, le CEA, Adisseo, Bioprotein
et Nokad.
Notez en particulier, qu’en septembre dernier, après le succès
d’un premier contrat de service débuté quelques mois plus
tôt pour Aventis Pharma, un second projet a été initié
entre BIOMETHODES et le groupe pharmaceutique. Un projet qui s’impose
déjà comme une réussite, puisque la société
BIOMETHODES est parvenue à mettre au point un système de sélection
à haut débit de protéines plus solubles ou mieux exprimées
compatible avec Massive Mutagenesis®. BIOMETHODES a protégé
cette technique par le dépôt d’un brevet. En associant
ce nouveau système de sélection à Massive Mutagenesis®,
BIOMETHODES peut désormais améliorer l’expression de protéines
qui sont classiquement mal exprimées, comme les fragments d’anticorps,
ou améliorer le rendement de production d’enzymes industrielles.
L’approche permettra aussi de faciliter la cristallisation et donc,
la caractérisation de certaines cibles thérapeutiques, une application
qui pourrait intéresser Aventis Pharma…
Une recherche interne et une politique de propriété
intellectuelle des plus dynamiques
BIOMETHODES a toujours souhaité développer cet axe prioritaire
qu’est celui des partenariats avec l’industrie, mais entend également
mener des projets de R&D en interne pour bâtir le futur à
moyen terme. Ainsi, était-il déjà précisé
en mai 2002 que “ si l’une des priorités de
BIOMETHODES repose sur l’extension de sa plate-forme actuelle, son activité
Recherche n’en est pas négligée pour autant ”. Depuis,
soutenue par une levée de fonds de 4,5 millions d’euros en octobre
2003, l’Entreprise a largement développé ses travaux de
recherche. Son portefeuille s’étend aujourd’hui à
neuf brevets ou demandes de brevets.
Deux nouveaux brevets ont notamment été déposés
en 2004, et de nouvelles technologies proposées, parmi lesquelles MM
XXL™, nouvelle approche qui repose sur la génération d’une
très large diversité, et ExhauSeq™, technologie la plus
aisée pour obtenir tous les mutants simples d’une protéine.
Soulignons qu’a été accordé aux Etats-Unis le brevet
sur une méthode de criblage de banques d'expression (DMD™, Digestion
Multiple Différentielle™) : une puissante méthode de criblage
fonctionnel en une seule étape de banques d’expression, qui permettra
d’identifier de nouvelles cibles thérapeutiques et de nouveaux
candidats vaccins.
A noter également qu’un brevet portant sur l'utilisation de puces
à ADN pour Massive Mutagenesis® est passé en phase d'extension
nationale.
Aujourd'hui encore, BIOMETHODES innove en déposant deux nouveaux brevets
: l'un sur une technique de sélection de mutants, l'autre sur une méthode
de recombinaison de gènes baptisée ShufflEasy™.
Un déménagement et de nouveaux
équipements
En croissance continue depuis sa création en 1997, BIOMETHODES a déménagé
de la pépinière et s’est installée dans un nouveau
bâtiment en décembre dernier. Ce nouvel espace de 815 m2
aménagé par la Société d’Economie Mixte
(SEM) Genopole® permet à l’Entreprise de renforcer sa plate-forme
d'optimisation de protéines et d’investir dans de nouveaux matériels,
notamment :
- de nouveaux éléments robotisés pour le criblage à
haut débit ;
- une unité de fermentation pour effectuer des essais pilotes, ce qui
lui permettra de mieux répondre à la demande de ses clients
industriels ;
- un laboratoire de niveau L2, en particulier pour ses travaux sur les protéines
thérapeutiques…
Des équipements qui viennent compléter les premières
bases dont disposait déjà BIOMETHODES dans le cadre de sa plate-forme
de criblage à haut débit : culture cellulaire, transfection,
expression génique, tests enzymatiques, fluorimétrie, luminométrie,
détection immunologique, microbiologie, analyses de gènes par
PCR, systèmes de digestion et d’extraction…
BIOMETHODES étend son unité de synthèse de gènes,
qui devient un départementà part entière, baptisé
Fidelis...
Une équipe renforcée
Ces développements, rendus possibles grâce à la confiance
témoignée par des clients tels que GlaxoSmithKline, Roquette
Frères, Biomérieux ou Aventis Pharma, ont appelé un renforcement
des équipes BIOMETHODES.
Forte de son installation dans des locaux plus vastes, l’Entreprise
a ainsi augmenté de près d’un tiers ses effectifs début
2005, pour compter aujourd’hui 30 personnes. Notez par ailleurs que,
pour accompagner cette croissance avec une image renouvelée, BIOMETHODES
vient de mettre en ligne un nouveau site web réactualisé (www.biomethodes.com).
“ C’est un tournant pour BIOMETHODES ”, commente
Marc Delcourt. “ Notre savoir-faire en matière d'amélioration
des enzymes et des anticorps a été largement démontré.
Aujourd'hui, nos technologies se sont considérablement enrichies et
vont nous permettre d'ouvrir de nouveaux marchés, mais aussi de nous
concentrer sur nos propres programmes de recherche… ”
S. DENIS