Juin 2007 - n°122

Le point sur PHYLOGENE

Créée en 1999, cette société a pour mission de développer les applications d’identification et d’authentification en utilisant la molécule d’ADN et les protéines. Ses activités de service et de R&D se sont affinées et Phylogene est devenue un acteur essentiel pour la filière agroalimentaire et l’industrie du diagnostic.

Avec une croissance moyenne de 31 % par an depuis ces 5 dernières années, la société Phylogene se porte bien et arbore un chiffre d’affaires 2006 de 540 000 euros… Notre dernier article datant d’avril 2000 (Gazette n° 47), nous allons voir comment a évolué l’entreprise.

Deux activités complémentaires

Lors de la création de Phylogene, la société s’était orientée vers l’identification des espèces animales et végétales entrant dans la composition des matières premières agroalimentaires et des aliments transformés (OGM et identification variétale). Gilbert Skorski, le principal fondateur ingénieur biochimiste et doté d’un MBA, est issu de l’industrie du diagnostic. Fort de son expérience, il oriente également l’entreprise vers le domaine de l’immunologie et plus particulièrement sur les acides nucléiques par le biais des techniques de PCR. L’axe fort est de renforcer la « traçabilité dans l’agroalimentaire ».

Depuis 2001, l’entreprise s’est aussi spécialisée dans le suivi d’allergènes dans la nourriture et depuis 2003, travaille à développer sa R&D vers les industries du diagnostic.

Aujourd’hui, l’entreprise se concentre sur deux activités : les services et la R&D à façon. Ses clients se trouvent parmi les acteurs de la chaîne agroalimentaire (les distributeurs, les transformateurs et leurs fournisseurs, les coopératives, les agriculteurs), les sociétés du diagnostic in vitro actives sur les marchés agroalimentaire, vétérinaire et humain.

Les services proposés concernent notamment la détection des OGM, des espèces animales et végétales et des allergènes pour les sociétés de l’agroalimentaire. Il faut savoir qu’environ 4 % de personnes en France sont allergiques à certaines nourritures et que ce secteur est en croissance. Les directives européennes demandent un étiquetage des allergènes et le domaine devient de plus en plus pointu. Phylogene se positionne vers l’agroalimentaire et propose son assistance aux industriels afin de maîtriser les contaminations croisées, et donc la quantité d’allergènes. L’entreprise fabrique une gamme d’échantillons contaminés avec un dosage cohérent. L’expertise va jusqu’à l’utilisation de sérums de patients allergiques. Des techniques spécifiques pourront ainsi être mises en place afin de détecter les allergènes dans la nourriture. La méthode d'approche combine l'utilisation des marqueurs protéine par ELISA ou ADN par PCR pour la détection et la quantification des espèces allergéniques.

L’identification variétale permet à Phylogene de détecter par exemple les variétés des huiles d’olive vierge. Alors que les producteurs français fournissent 4 000 tonnes par an, la France consomme 70 000 tonnes, d’où l’importation d’huiles d’olive provenant d’autres pays. Pour se différencier, les producteurs français misent sur la qualité et notamment une traçabilité qui précise l’origine et les variétés d’olives utilisées. Certaines huiles provençales notamment certifient leur provenance, investissent dans des tests de contrôle et prônent un packaging de luxe.

Les autres services concernent la traçabilité bovine, le dosage des microcystines, l’identification de corps étranger…

Côté R&D, Phylogene met au point des produits de diagnostic sous la forme de kits. Ils sont créés pour les clients issus de l’industrie du diagnostic. Les sociétés souhaitant mettre au point des techniques analytiques adaptées, ou bien les sociétés du diagnostic in vitro souhaitant développer des kits de diagnostic sont ainsi concernées. Tout est fait à partir d’un cahier des charges fonctionnel rédigé conjointement, qui comprend des spécifications et un planning prévisionnel. Une attention particulière est portée sur le fonctionnement dans le Système Qualité du client et dans le transfert du produit vers ses structures de RetD et de fabrication.

Par exemple, un kit de détection des OGM est mis au point pour une société de diagnostic qui va ensuite le produire. En effet, les kits analytiques (détection OGM, détection variétale et détection allergène) seront lancés dans cette optique.

L’entreprise développe des technologies dans le domaine de la multidétection par le biais de contrats confidentiels avec ses clients, mais aussi sur des techniques liées aux acides nucléiques.

De nouveaux locaux

Actuellement, 9 personnes, spécialisées en biologie moléculaire et en immunologie (ingénieurs, DESS), travaillent chez Phylogene. L’entreprise a investi de nouveaux locaux de 300 m² lors de l’été 2006, près de Nîmes. Environ 250 m² sont dédiés aux laboratoires avec des salles blanches spécifiques (air en surpression) pour l’analyse de l’ADN et la PCR.

Les laboratoires ont plusieurs espaces :

- Une partie dans laquelle s’effectue la préparation de l’échantillon, équipée de broyeurs capables de traiter tous types d’échantillons.

- Une partie consacrée à l’extraction, à la purification de l’ADN à analyser et à la préparation des réactions d’amplification de l’ADN. Cette partie, très importante pour la pureté de l’analyse se fait dans un environnement particulier. Les opérations correspondantes se font dans des locaux séparés dans lesquels l’air est en surpression. Ces précautions ont pour but d’empêcher la présence d’ADN amplifié d’un autre échantillon par un retour d’air du laboratoire aval dans lequel s’effectue l’identification.

- Une partie dans laquelle l’ADN est amplifié puis analysé. Cette partie est équipée des appareils nécessaires : thermocycler (amplification de l’ADN), fluorothermocycler (amplification de l’ADN en continu), postes d’électrophorèse, analyseurs d’image.

- Une partie, équipée de laveurs et spectrophotomètres, et de hottes à flux laminaire, dans laquelle les tests ELISA sont effectués,
Phylogene participe activement à des programmes de recherche européens avec l’Italie, l’Espagne et l’Allemagne. La société collabore également avec des laboratoires de l’INRA et du CNRS de Montpellier.

Forte de ses nombreux atouts, la société Phylogene souhaite devenir un prestataire de choix dans le domaine du diagnostic avec notamment la mise au point de techniques innovantes, mais aussi avec le développement de techniques dans le domaine des biopuces.

M. HASLÉ