Juillet 2008 - n°134

MUTABILIS, leader de la recherche sur l'anti-virulence

Spécialisée dans la découverte et le développement de nouveaux traitements antibactériens, la société biopharmaceutique MUTABILIS cible tout particulièrement les infections bactériennes graves, et notamment les infections nosocomiales. Spin-off de l'INSERM, fondée en août 2001, l'entreprise emploie aujourd'hui plus de 20 personnes et dispose de 600 m2 de locaux au sein du parc technologique Biocitech, en région parisienne.

Une spin-off de l'Inserm

MUTABILIS a vu le jour il y a sept ans sur la base des recherches menées par l'équipe du professeur Xavier NASSIF (Inserm U570). Utilisant ainsi les résultats des travaux centrés sur la technologie de mutagenèse, l'entreprise a tout d'abord réalisé, dans une bactérie modèle à Gram négatif, l'identification exhaustive des gènes nécessaires à la multiplication et à la dissémination de bactéries dans les milieux extracellulaires lors des infections systémiques. Elle a ensuite validé et breveté toutes ces cibles biologiques de virulence qui favorisent la croissance bactérienne dans les milieux extracellulaires.
Grâce à sa connaissance approfondie des génomes bactériens, des voies métaboliques et des inhibiteurs potentiels, la société MUTABILIS entend découvrir et développer des agents anti-infectieux innovants au mécanisme d'action original. Elle souhaite ainsi répondre aux problèmes actuels de résistance aux antibiotiques et cibler les infections bactériennes sévères.

Deux approches R&D et une expertise unique dans des domaines clés

La R&D innovante de MUTABILIS sur les antibactériens est basée sur deux approches :
=> La première consiste à développer une nouvelle classe de molécules antibactériennes à faible poids moléculaire qui ciblent des enzymes essentielles, spécifiques au staphylocoque S. aureus multi-résistant (SARM).
=> La seconde approche implique un nouveau concept antibactérien : « l'anti-virulence » ; un concept utilisé pour découvrir de nouveaux médicaments visant de manière sélective les bactéries pathogènes dès qu'elles se répandent dans la circulation sanguine ou dans les milieux extracellulaires, sans empêcher la prolifération de la flore bactérienne normale.

MUTABILIS se spécialise ainsi dans l'inhibition de mécanismes bactériens essentiels à la virulence. Son équipe a atteint, à ce jour, plusieurs étapes importantes de ses programmes de développement et a développé une expertise unique dans les domaines suivants :
* l'identification in vitro et in vivo de gènes largement conservés dans des espèces pathogènes majeures, et essentiels à l'établissement des infections ;
* l'identification de nouvelles entités chimiques et des programmes de découvertes de médicaments pour développer de nouveaux inhibiteurs de virulence à spectre antibactérien étroit, dirigés contre des pathogènes Gram négatifs ou Gram positifs ;
* la découverte d'antigènes qui protègent contre des souches pathogènes afin de développer de nouveaux vaccins.

Un portefeuille équilibré de produits et de technologies

Forte de ses propres équipes de recherche en biologie et chimie médicinale, MUTABILIS s'est focalisée sur la R&D de nouvelles classes thérapeutiques d'agents anti-infectieux. La société a l'intention de réaliser la recherche préclinique et les premières étapes du développement clinique de ces composés jusqu'en phase II. Après avoir obtenu la preuve clinique du concept, elle cédera ses composés/cibles sous licence.

un candidat anti-SARM en développement préclinique :

MUTABILIS a identifié un antibiotique qui pourrait être utilisé pour traiter les SARM. Le candidat médicament a démontré une très forte activité contre une large gamme de staphylocoques et présente un bon profil d'innocuité. Il a également donné des résultats très prometteurs in vivo dans des modèles d'infection par SARM comparé au linezolide et à la vancomycine. L'équipe MUTABILIS prévoit de déposer une demande de IND avant la fin de 2008 ; elle entend ainsi terminer les essais cliniques de phase I et céder ensuite ce programme sous licence.

une série de leads d'anti-virulence pour les Gram positif, contre S. aureus et/ou les streptocopques :

Un deuxième programme de découverte de médicaments vise à identifier des agents d'anti-virulence dirigés contre les bactéries à Gram positif. MUTABILIS optimise actuellement plusieurs séries de leads et a déjà pu démontrer in vivo la première preuve du concept pour une molécule d'anti-virulence. L'optimisation des composés (particulièrement contre S. aureus) est en cours ; MUTABILIS cherchera ensuite à poursuivre ces programmes dans le cadre de partenariats.

un nouveau vaccin contre la prévention des infections urinaires, actuellement en cours de développement chez Novartis:

MUTABILIS a utilisé la comparaison génomique (hybridation soustractive) pour identifier des antigènes spécifiques et protecteurs codés par des gènes, présents exclusivement dans les souches pathogènes. Un candidat vaccin pour la prévention des infections urinaires a été cédé sous licence à la société Chiron, aujourd'hui entité du groupe Novartis.

A noter également, entre autres produits et technologies du portefeuille MUTABILIS : une série de leads d'anti-virulence pour les Gram négatifs, des antigènes spécifiques aux souches pathogènes d'E. coli à des fins de criblage et d'immunisation passive, mais aussi une chimiothèque fondée sur des critères stricts de « drugability » et de chimie médicinale, ainsi que des demandes de dépôt de brevets et des licences issues de l'INSERM.

Une équipe de 23 personnes et 600 m2 de laboratoires

MUTABILIS emploie aujourd'hui 23 personnes dont 5 docteurs en chimie organique, un pharmacien et 5 docteurs en biologie (microbiologie, pharmacologie, enzymologie, biologie moléculaire). Ses installations au cœur du parc Biocitech, à Romainville (93), s'étendent sur 600m2 ; elles intègrent notamment un laboratoire de microbiologie L2, deux laboratoires de chimie, un laboratoire de biochimie enzymologie et criblage, ainsi qu'une animalerie. Entre autres matériels : des lecteurs de fluorescence et luminescence, un robot passeur de plaques, des chaînes LC-MS, HPLC analytique et préparative….

Précisons que la société MUTABILIS a mis en place une plate-forme de mutagénèse du génome complet pour identifier les facteurs de virulence in vivo et in vitro ; elle a en outre développé une plate-forme spécifique de tests biochimiques et microbiologiques pour cribler les molécules antibactériennes et anti-virulence, et associe dans le cadre d'approches rationnelles la biologie structurelle, la chimie par modélisation moléculaire et la chimie médicinale.

Leader de la recherche sur l'anti-virulence, MUTABILIS peut compter sur un solide portefeuille de brevets et de produits, ainsi que sur une équipe de direction expérimentée, placée depuis janvier 2008 sous la direction générale de M. Stefan FISCHER. Les programmes de R&D conduits par MUTABILIS ont déjà généré des séries de nouvelles entités chimiques présentant un nouveau mécanisme d'action et une preuve de concept démontrée. L'Entreprise entend désormais finaliser un nouveau tour de financement avant la fin 2008.

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