2021-10-14 

Des génomes entiers assemblés sur de simples ordinateurs portables

Des chercheurs de l'Institut Pasteur et du Massachusetts Institute of Technology (MIT) ont mis au point une technique de reconstruction rapide de génomes entiers, pouvant s'appliquer par exemple au génome humain. S'inspirant du traitement automatique des langues, qui permet d'agencer des mots plutôt que des lettres, les chercheurs ont entrepris de représenter les données génomiques par des blocs de lettres. Cette méthodes leur a permis de reconstruire un génome humain en un temps record, et avec des moyens informatiques considérablements réduits : la reconstruction est cent fois plus rapide et ne nécessite qu'un cinquième des ressources génomiques actuelles, comparée aux approches d'assemblage existantes, pourtant de pointe. L'étude a été publiée le 14 septembre 2021 dans la revue Cell Systems.
 
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